В числе четырех факультетов Казанского университета, основанного в 1814 г., был и медицинский под названием «Отделение врачебных наук», он имел 6 кафедр. 

Преподавание велось на латинском языке, с объяснениями на французском и немецком языках. В первые 9 лет (1814-1823 гг) существования медицинского факультета КУ знания по детским болезням преподавались только по периоду новорожденности в курсе повивального искусства. Преподавание педиатрии для студентов, как самостоятельной дисциплины, в тот период ни в Казанском, ни в других университетах России еще не проводилось.

В 1823 г. профессор повивального искусства КУ Александр Егорович Лентовский (1798-1867 гг) выделил учение о женских и детских болезнях и на 10 лет раньше чем Медико-хирургической Академии начал читать специальный цикл лекций детских болезней, не ограничиваясь только периодом новорожденности. Он включил в программу преподавания вопросы физиологии и патологии детей других возрастов, а также детские инфекционные болезни, ввел понятие о врожденных и приобретенных заболеваниях. В 1844 г. было организовано практическое преподавание студентам детских болезней, с 1850 г. было введено обязательное ведение истории болезни.

В 1875 г. на базе медицинского факультета КУ была образована кафедра педиатрии. Первым руководителем этой кафедры был профессор Николай Александрович Толмачев (1823-1901 гг.) по специальности акушер. Можно считать, что с этого момента началось становление научной педиатрии в Казани. Он в течение 7 лет (1875-1882 гг.) нес большую педагогическую работу один без помощников. Затем – 1 приват-доцент, а с 1893г. – два приват-доцента. Николай Александрович глубоко изучал проблему о врожденных заслонках уретры, как одной из причин расстройства мочеиспускания у детей, усилил практический курс преподавания педиатрии, расширил вопросы по вскармливанию и выхаживанию недоношенных детей, изучал состав женского и коровьего молока. С его участием были оборудованы клинические и биохимические лаборатории (1876 г.). Был инициатором открытия детской амбулатории в здании старой факультетской клиники в 1879 г. Н.А. Толмачев проявил себя как хороший организатор здравоохранения, ходатайствовал о строительстве детской клиники и сам предложил проект ее устройства. Надо отметить активность, целеустремленность Толмачева: чтобы открыть детский стационар всего на 6 коек (1890г.), он в течении 18 лет более 30 раз официально обращался в различные инстанции. В 1893 г. в связи с ухудшением состояния здоровья Н.А.Толмачева заведовать кафедрой детских болезней университета был приглашен первый профессор-педиатр Петр Михайлович Аргутинский – Долгоруков (1850-1911 гг.), получивший педиатрическую подготовку в Петербурге под руководством одного из крупнейших педиатров того времени К.А.Раухфуса. Высокообразованный, владеющий многими иностранными языками, Петр Михайлович изучал способы определения азота в органических соединениях, анатомо-физиологические особенности детского организма (спинного мозга, почек, щитовидной железы), серотерапию скарлатины у детей, работал над выявлением ранних форм детского туберкулеза, много сил затратил на борьбу с малярией. П.М.Аргутинский представлял Казанский университет на IY-м международном Медицинском конгрессе в Мадриде в 1903г как крупный знаток малярии. В 1899 г. выделил из курса детских болезней приват-доцентский практический курс по детской неврологии и инфекциям детского возраста. Его учениками являются: проф. В.К.Меньшиков, Е.М.Лепский, А.Ф.Агафонов (Казань), проф. В.Н.Воробьев (Краснодар), проф. И.Н.Быстренин (Саратов), проф. П.Н.Пичугин (Пермь). После смерти П.М.Аргутинского, с 1912 г. проф. Виктор Константинович Меньшиков (1874-1945 гг.) возглавил кафедру с клиникой и начал читать полный курс лекций по детским болезням с инфекциями. 7 мая 1906 года он получает звание доктора медицины, и в этом же году избирается приват-доцентом кафедры детских болезней.
17 апреля 1912 года В.К. Меньшиков избирается экстраординарным профессором, а через 6 лет, 29 апреля 1918 года, после освобождения ваканции - ординарным профессором кафедры детских болезней Университета. В программу по изучению педиатрии, составленную для студентов, В. К. Меньшиков включает и расширяет темы по раннему периоду развития ребенка, вскармливанию и ранней диагностике различных заболеваний с привлечением рентгенологического и лабораторного обследования, в частности, ранней рентгенологической диагностике туберкулеза у детей. Большое внимание уделял диетическому вскармливанию детей при расстройствах питания, при острых инфекциях.

В клинике, руководимой В. К. Меньшиковым в течение 46 лет, большое внимание в годы Советской власти стало уделяться подготовке национальных врачебных кадров. Под руководством профессора коллектив кафедры подготовил к печати перечень педиатрических терминов на татарском языке. В своей клинике Виктор Константинович организовал отделение для грудных детей по образцу Европейских клиник. Педагогическая, научная, врачебная и общественная деятельность В.К. Меньшикова была достойно оценена еще при его жизни Народным комиссариатом здравоохранения РСФСР, ТАССР, правительственными наградами, признанием многочисленных пациентов, что дало возможность присвоить клинике его имя.

В 1930-м году медицинский факультет Казанского университета был выделен в самостоятельный медицинский институт, а в 1934-м году был создан педиатрический факультет и кафедра педиатрии. Большую организационную работу по созданию педиатрического факультета провел Ефим Моисеевич Лепский, первый декан факультета. Плодотворная научно-исследовательская деятельность Е.М.Лепского была отражена в 108 научных работах, в том числе 10 монографиях по актуальным проблемам педиатрии. В 1945-1950 гг. по совместительству руководил кафедрой госпитальной педиатрии педфака КГМИ, оставаясь на своей основной работе в институте усовершенствования врачей. Е.М.Лепский пользовался огромным авторитетом в вопросах витаминологии, рахита, детского туберкулеза и др. проблем. В 1945-46 годы была организована кафедра детских болезней педиатрического факультета, в последующем реформированная в кафедру госпитальной педиатрии, из которой в 1949-50 годы была выделена кафедра факультетской педиатрии, в последующие годы - кафедра поликлинической педиатрии, курс детской эндокринологии. В 1952 году в связи с болезнью Е.М. Лепского кафедру госпитальной педиатрии возглавил ученик профессора В.К.Меньшикова профессор Евгений Николаевич Короваев и руководил ею в течение 10 лет. Кафедра продолжала изучение проблем рахита, возрастных особенностей и реактивности детей, больных ревматизмом, малярией, заболеваний органов дыхания.

С 1962 года после смерти Е.Н. Короваева кафедрой госпитальной педиатрии руководит профессор Хамидуллина Абруй Хусаиновна - первая татарская женщина - педиатр, ставшая профессором, заведующей кафедрой. Начиная с 1962 года, на кафедре развертываются комплексные исследования по изучению реактивности детского организма в норме и патологии, аллергии в возрастном аспекте (включая вопросы становления механизмов естественной защиты и адаптации), неонатологии.

С именем профессора А.Х. Хамидуллиной связано становление неонатологической службы в нашей республике. Еще до открытия первой в СССР кафедры неонатологии (в 1974г. Москва, ЦОЛИУВ) на кафедре проводились научно-исследовательские работы по разным проблемам физиологии и патологии детей периода новорожденности, оказывалась практическая консультативная помощь. На кафедре впервые акцентированы проблемы организации детского здравоохранения в г. Казани, республиках Поволжья. Кафедра одной из первых занималась проблемами влияния экологических (производственных и внешних) факторов на состояние реактивности организма еще в онтогенезе в норме и при патологии, аллергии в возрастном аспекте. Результаты проводимых на кафедре исследований позволили создать в 1969 году аллергологический кабинет при Республиканской клинической больнице. Впервые был налажен диспансерный учет и лечение детей с аллергическими заболеваниями, лекарственными и вакцинальными аллергическими реакциями. Коллектив кафедры занимался изучением медицинской географии и структуры аллергических заболеваний у детей Татарской АССР и соседних административных территорий. Под руководством А.Х. Хамидуллиной 25 ее учеников защитили кандидатские диссертации, 8 из которых впоследствии стали докторами медицинских наук.

С 1978 по 1986 г. кафедру возглавила профессор Нина Алексеевна Романова. В этот период основной учебной базой кафедры стала только что открытая многопрофильная Детская республиканская клиническая больница МЗ ТАССР, располагающая большими возможностями для обучения и формирования клинического мышления у выпускников педиатрического факультета.

Кафедра работала в тесном контакте с МЗ РТ, в этот период работы сотрудники кафедры работали главными внештатными специалистами МЗ РТ по неонатологии, детской пульмонологии, детской аллергологии, нефрологии. В разные годы в силу вполне объективных причин название и структура кафедры несколько раз изменялось: госпитальная педиатрия, в 80-е годы вновь объединение с факультетской педиатрией, в 1991 году был открыт курс неонатологии и кафедра называлась кафедрой детских болезней № 2 с курсом неонатологии, с 2004 года кафедра вновь называется кафедрой госпитальной педиатрии с курсом ПДО, а в 2006 году кафедра была объединена с кафедрой поликлинической педиатрии.

C 1986 года кафедру возглавляет доктор медицинских наук, Врач педиатр Высшей категории, Заслуженный врач РФ, профессор Булатов В.П., Главный внештатный детский гастроэнтеролог МЗ РТ.

В настоящее время научная работа кафедры проводится в соответствии с проблемой "Улучшение охраны здоровья детей и совершенствование лечебно - профилактической помощи детям". Основными направлениями являются вопросы детской гастроэнтерологии, нефрологии, кардиологии и неонатологии. Основная лечебно-консультативная и научно-исследовательская работа кафедры проводится в профильных соматических отделениях ДРКБ МЗ РТ, в отделениях новорожденных РКБ, родильного дома №1 и Клиники медицинского университета.

На кафедре сформировался высококвалифицированный научно-педагогический коллектив из 22 человек, из них 4 профессора курируют основные направления работы (Булатов В.П. осуществляет общее руководство и по гастро-билиарной патологии, Фазлеева Л.К. - неонатологию, Макарова Т.П. - нефрологию и руководство курсом ПДО, А.П. Пигалов – заведует курсом поликлинической педиатрии), 10 доцентов и 8 ассистентов. Остепененность ППС составляет 95%. Состав кафедры постоянно дополняется молодыми кадрами из числа студенческой молодежи, занимавшейся в студенческом научном кружке.

За время заведования профессором Булатовым В.П. на кафедре выполнены более 20 кандидатских и 4 докторских диссертационных работ по различным проблемам педиатрии. По ходу выполнения работ были получены патенты, приоритетные справки и рационализаторские предложения. Изданы учебники, утвержденные УМО РФ:
1. "Клиническая фармакология”, 2003.
2. "Гематология детского возраста”, 2005.

За эти годы издано более 50 учебно-методических пособий для студентов, интернов, ординаторов, практических врачей. Кафедра осуществляет подготовку клинических ординаторов, интернов педиатров и неонатологов по программе курса последипломного образования, сотрудники кафедры регулярно выезжают на проведение сертификационных циклов в города РТ и республики Марий Эл.

Основную задачу коллектив кафедры видит в подготовке врачей-педиатров, способных в любой момент оказать квалифицированную помощь больному ребенку, способных к состраданию, милосердию, способных к постоянному профессиональному самоусовершенствованию и продолжателей славных традиций.